Arquitetos austríacos ganharam um concurso para este projeto em 2001, e sua implementação não foi fácil: o processo de construção foi interrompido por dois anos, e sua primeira fase incluiu exclusivamente a construção de uma fundação por estacas (o comprimento total das estacas cravadas era de 536 m). Eles eram necessários, uma vez que o museu foi erguido em um solo costeiro fraco - na confluência do Ródano e Sona. Confluence se traduz em "mesclar"; é também o nome de toda a área adjacente à "seta" (ponto de confluência, "ponto de confluência").
O museu é um edifício importante à escala da cidade: a sua localização proeminente torna-o um "farol" e um símbolo de todo o novo distrito de Confluência - uma antiga península-zona industrial perto do centro de Lyon, que agora está a ser construída com cultura instituições, escritórios e edifícios residenciais projetados por arquitetos de destaque.
O edifício Coop Himmelb (l) au está localizado em vias pedonais movimentadas, portanto, para não criar um obstáculo à circulação dos cidadãos, o edifício é elevado acima do solo, e por baixo dele existe uma "praça" com uma lanchonete.
O Museu Confluence consiste em três partes. O "pedestal", no qual se encontra a referida "praça", acomoda dois auditórios (para 327 e 122 lugares, respetivamente), locais para alunos de escolas próximas, depósitos e oficinas, salas de reuniões. Cristal envidraçado é um saguão com rampa em espiral, escadas e elevadores, além de uma livraria. O terceiro e mais importante volume é uma "nuvem" de aço inoxidável com uma estrutura de suporte como uma ponte. Existem 9 salas (4 para exposições permanentes e 5 para exposições temporárias) e oficinas "públicas"; o nível superior abriga os escritórios da administração, e a cobertura abriga um café e painéis solares. Os braços cantilever "voadores" do edifício são inspirados por correntes de água que se fundem lado a lado.
O orçamento do projeto foi de 185 milhões de euros (3.980 euros por metro quadrado).
