O complexo do museu adquiriu dois novos andares superiores, bem como uma fachada amarela brilhante de 8 milhões de azulejos de cerâmica. A tarefa do arquiteto e da administração do museu era transformar o museu infantil mais antigo do mundo (inaugurado em 1899) em um centro educacional moderno, voltado não apenas para o público infantil, mas também como um "centro comunitário" para os residentes do Brooklyn.
O prédio reformado conta com biblioteca, novas salas de exposições, cafés e salas de aula. A esplanada com teatro de verão, que existe desde 1970, está agora mais ligada ao resto do edifício graças às novas escadas e átrios. Corrimãos e janelas adicionais em um nível mais baixo do que o normal, outros detalhes internos lembram os visitantes que este edifício foi projetado principalmente para crianças; e que seus corredores estão repletos não apenas de curiosos artefatos das ciências históricas e naturais, mas também de brinquedos e atrações, incluindo uma caixa de areia com areia azul.
O Brooklyn Children's Museum deve se tornar o primeiro museu no estado de Nova York a receber a certificação de energia LEED prata: poços geotérmicos são usados para aquecer e resfriar o prédio, painéis solares são instalados nas fachadas e ecossensores regulam a iluminação e a ventilação sistemas.
