O museu, que contém as famosas telas gêmeas "Irises" do artista do século 17 Ogata Korin, bem como uma variedade de pinturas, esculturas e artes e ofícios do Japão, China e Coreia, está localizado no território de um antigo solar da cidade perto do movimentado Omotesando Boulevard.
O objetivo da reconstrução era criar uma sensação de "wa" - "harmonia japonesa" para o visitante. A tarefa prática de Kuma era preservar o caráter isolado e fechado do complexo, ao mesmo tempo que seguia os princípios da arquitetura japonesa. O projeto resultante combina os elementos individuais e princípios gerais da arquitetura tradicional com a linguagem do modernismo, que simplificou e tipificou detalhes e formas.
O edifício sob uma pesada cobertura de duas águas, com enfatizados apoios verticais, adquiriu paredes quase inteiramente de vidro - esta é uma homenagem ao século 21, e um reflexo da "permeabilidade" de uma casa tradicional japonesa, sua estreita ligação com a natureza circundante (neste caso, com o jardim). O bambu é amplamente utilizado - desde paredes externas e tetos até bancos e armários no depósito.
Se o edifício principal foi reconstruído e dobrado de tamanho, o café do museu foi completamente reconstruído. Neste pequeno edifício, Kuma utilizou o vidro e o papel oleado como principais materiais, reunindo modernidade e tradição.
