A própria Rego, considerada a maior artista portuguesa do nosso tempo, escolheu ela própria o arquitecto para a “Casa das Histórias” (é este o nome oficial do museu). Provavelmente foi importante para ela sombrear suas telas emocionalmente ricas com o pano de fundo contido da arquitetura de Souto de Moura. No entanto, neste projeto ele se afastou do minimalismo estrito: isso se refletiu tanto no material escolhido (este é o concreto cru vermelho) quanto na composição (o papel principal é desempenhado por duas torres piramidais "icônicas").
Nessa solução, percebem-se as características do regionalismo: as "pirâmides" emparelhadas não são nem uma forma geométrica abstrata, nem, além disso, uma referência à arquitetura do Mundo Antigo: o arquiteto se inspirou nos enormes tubos cônicos do Fogões de cozinha do Palácio Real de Sintra perto de Lisboa. No museu, essas formas de alguma forma mantiveram sua função: em uma torre há um café, na outra - uma loja de souvenirs.
O próprio edifício consiste em quatro edifícios que convergem em torno da sala central - o salão de exposições temporárias. As paredes dos espaços expositivos são revestidas com gesso leve, o piso é pavimentado com mármore cinza extraído perto de Kayshkash. O museu também possui um auditório com 200 lugares.
