O projeto de reforma foi patrocinado pelos espanhóis Cruz y Ortiz, a exposição foi projetada por Jean-Michel Wilmotte e a restauração foi realizada por Van Hoogevest Architecten. A tarefa dos arquitetos foi adaptar o volumoso edifício no mainstream do ecletismo, construído em 1885 por Petrus (Pierre) Kuypers, para as necessidades de um museu do século XXI. Interiores exuberantes desviaram a atenção das exposições, não havia espaço suficiente para as exposições e o programa que as acompanha, era impossível organizar a exposição permanente de acordo com um único sistema e assim por diante.
Agora, todas as exposições do século 12 ao 20 são organizadas em estrita ordem cronológica, por pisos de baixo para cima, e a cronologia é sustentada por um esquema de cores: a pintura nas paredes vai gradualmente iluminando à medida que sobe, chegando quase branco nos corredores da arte moderna. Ao mesmo tempo, todas as obras foram dispostas de uma nova forma, com exceção da mais importante - "Ronda Noturna" de Rembrandt, que voltou ao seu antigo lugar na "Galeria de Honra", onde se encontram as obras do Golden Idade da arte holandesa são exibidos.
Os arquitectos, de acordo com o esquema já estabelecido na construção museológica, bloquearam dois pátios do edifício com telhados de vidro, e também os aprofundaram ao nível do piso -1, tendo retirado previamente os posteriores prolongamentos que os ocupavam. Em seguida, eles colocaram um auditório sob um pátio e uma loja de museu e um café sob o outro. Os próprios pátios se transformaram em espaços públicos espaçosos que podem ser acessados mesmo sem a compra de um ingresso. Suas paredes formam as fachadas do pátio do museu, e as novas superfícies são revestidas com pedras de cores claras. Antonio Cruz e Antonio Ortiz levaram em consideração o erro de Norman Foster, em cujo pátio do Museu Britânico qualquer som é claramente audível e até mesmo ecoa, portanto, no Rijksmuseum, os ruídos são abafados por grades brancas com material absorvente de som suspenso no teto.
Mas o principal problema para os arquitetos era a união dos dois pátios em um único todo. O edifício histórico possui um corredor pedonal e ciclista no centro da fachada, permitindo uma passagem rápida pelo edifício. O projeto de reconstrução previa transformá-lo na entrada principal do museu, unindo os dois pátios, mas os habitantes da cidade se rebelaram e agora o corredor está preservado em sua forma original, o acesso ao museu pode ser feito por quatro pequenas entradas e uma passagem subterrânea foi construída embaixo dele, conectando os pátios uns com os outros.
O museu foi fechado para reconstrução em 2003 e ia abrir já em 2008. O período de trabalho de 10 anos é explicado pelo fato de que esforços titânicos tiveram que ser feitos para construir níveis subterrâneos no solo cheio de água de Amsterdã, e não havia empreiteiro para um projeto tão complexo. Os engenheiros da Arcadis tornaram as novas partes subterrâneas do edifício estruturalmente independentes da estrutura histórica, à medida que ela desaparece lentamente. Portanto, o corredor de solo e a "Galeria de Honra" localizada acima da passagem subterrânea entre os pátios foram agora transformados em uma "ponte" suspensa sobre ele. Os poços cavados eram imediatamente enchidos com água, então eram despejados com concreto especial para trabalhos subaquáticos, e o processo era controlado por mergulhadores.
O orçamento do projeto foi de 375 milhões de euros, mas também inclui a construção de um pavilhão separado de arte asiática, colocado no centro do lago, a adaptação do parque a um jardim de esculturas pelo projeto Copijn Landschapsarchitecten (14.500 m2), a construção de um prédio de entrada de serviço, a reconstrução da histórica Escola de Desenho (Teekenschool) como um centro educacional de museu, bem como a construção de um prédio de oficinas de museu perto do Rijksmuseum, fundido com outro edifício Kuypers - o antigo Instituto da Segurança e Saúde Ocupacional.
Mas a reforma do museu ainda não foi concluída: permaneceu aberto durante a reconstrução
a ala Philips agora será convertida em um moderno espaço de exposição temporária. Os autores do projeto também são Cruz y Ortiz.
