O novo complexo é composto por sete edifícios fabris da década de 1910 (armazéns, laboratórios e tanques de fermentação) e três novos edifícios - o Museu (espaços para exposições temporárias), o Cinema (sala multimédia) e a Torre de 10 pisos (edifícios para a exposição do acervo próprio da Fundação Prada; será inaugurado um pouco mais tarde), além de um amplo pátio. Da área total de 18.900 m2, 11.000 m2 estão alocados para exposições.
Ao descrever a sua construção, Rem Koolhaas observou que a atual “incrível expansão do sistema artístico” não foi acompanhada por um aumento no número de tipos de edifícios de exposição: são muito poucos. Do tipo mais popular, que já serviu aos seus edifícios industriais, os artistas escolhem como opção neutra "à revelia", que não entra em conflito com as suas obras.
Ao contrário de muitos outros exemplos semelhantes, a fábrica da Prada no distrito de Largo Isarco de Milão exibe um grande “repertório” de formas e tipos de espaço, muitas vezes contrastantes - estreito e largo, claro e escuro, aberto e fechado. De acordo com Koolhaas, essa variedade de arquitetura vai desafiar a arte e contribuir para a criação de projetos originais.
Além disso, o arquitecto voltou-se para o tema da conservação do património, que ainda lhe interessa. Ele considera que seu projeto não é nem uma "conservação", nem um novo edifício, mas algo intermediário. A interação constante desses dois "estados" não permitirá que partes da estrutura se fundam em uma única imagem, ou um de seus componentes - ganhe supremacia sobre o resto.
No geral, o complexo - apesar de seu cliente "luxuoso" - tem uma solução bastante modesta. Apenas um dos edifícios, coberto com douramento, atrai a atenção de longe (Koolhaas afirma que tal solução de fachada é mais acessível do que mármore ou mesmo pintura). Além disso, foi utilizada espuma à base de alumínio nas fachadas e interiores.
Além do desenvolvimento do projeto arquitetônico, a OMA também atuou como autora do desenho da primeira exposição do complexo de Milão. Serial Classics (com curadoria de Salvatore Settis) explora a relação controversa entre autenticidade e imitação na Roma antiga por meio das muitas cópias romanas de esculturas gregas que podem ser vistas como um tributo à cultura grega.
A entrada da Fundação Prada conta com um restaurante projetado pelo cineasta Wes Anderson e uma área infantil projetada por alunos da Escola de Arquitetura de Versalhes.